塩基配列から塩基多様度などの統計量を求めるのは DnaSP がメジャーなプログラムですが，バージョン 5.10 では塩基多様度の分散を求めることができません。分散を求めるにはブートストラップを行えばよいのですが，ブートス もっと見る
塩基配列の多型サイトをキャッシュすると計算が速くなる
19 1月, 2010
遺伝学 のタグアーカイブ
MgCl2 を用いた PEG 沈殿
13 1月, 2010
PEG 沈殿といえば NaCl を用いたものが一般的かと思うのですが， MgCl2 を用いたプロトコールもあるようです[A]。 10 mM の MgCl2 存在下で， PEG 8000 の濃度を調整すると，サイズ選択的に もっと見る
UniProtKB の XML を LINQ で処理
14 11月, 2009
世界には沢山の優れた遺伝情報のデータベースが存在します。 UniProtKB はその 1 つで，タンパク質のデータベースです (knowledge base)。 UniProt を私が好む理由としてはクエリでレビューされ もっと見る
C# の列挙型がインターフェイスを実装できないのが不便
06 11月, 2009
C# の列挙型は Java のそれとは異なりインターフェイスを実装することはできません。普段はあまり困ることはないのですが，困ることもあるのです。 ゲノミクスではしばしば FASTA 形式 のファイルを扱います。 FAS もっと見る