塩基配列から塩基多様度などの統計量を求めるのは DnaSP がメジャーなプログラムですが，バージョン 5.10 では塩基多様度の分散を求めることができません。分散を求めるにはブートストラップを行えばよいのですが，ブートス もっと見る
塩基配列の多型サイトをキャッシュすると計算が速くなる
19 1月, 2010
科学 のカテゴリーアーカイブ
科学に関連する項目です。自然科学についての事柄がほとんどになります。必ずしも科学的に正しいことを書くとは限りません。いわゆる疑似科学も面白ければ OK なスタイルです。
MgCl2 を用いた PEG 沈殿
13 1月, 2010
PEG 沈殿といえば NaCl を用いたものが一般的かと思うのですが， MgCl2 を用いたプロトコールもあるようです[A]。 10 mM の MgCl2 存在下で， PEG 8000 の濃度を調整すると，サイズ選択的に もっと見る
Ubuntu で maxima を使うとエラーが出る場合の対処
13 12月, 2009
Ubuntu で maxima を使おうとすると以下のようなエラーが出ます。 Universal error handler called recursively (:ERROR NIL CONDITIONS::CLCS もっと見る
酸素漂白
13 12月, 2009
コーヒーの紙フィルターに｢酸素漂白｣と書いてありました。普通に酸素漂白と言えば過酸化水素，過炭酸ナトリウム，オゾンあたりを指すそうです[A]。いずれも活性酸素と呼ばれるものです。 酸素と言うとなんとなくイメージは良いのか もっと見る
UniProtKB の XML を LINQ で処理
14 11月, 2009
世界には沢山の優れた遺伝情報のデータベースが存在します。 UniProtKB はその 1 つで，タンパク質のデータベースです (knowledge base)。 UniProt を私が好む理由としてはクエリでレビューされ もっと見る