近似ベイズ計算の実装例


『近似ベイズ計算によるベイズ推定』の逐次モンテカルロ法を R で実装してみました。 Sisson et al. (2007) で例示されている 2 つの正規分布 , の混合分布からのサンプリングを行います。

コアレセントシミュレーターを実装する (2)


「コアレセントシミュレーターを実装する (1)」では突然変異がない場合の標準中立モデルに基づくコアレセントツリーの作成までを実装しました。普通の集団遺伝学の教科書でもそうであるように,次に考慮されるのは突然変異です。 と もっと見る